當蓄電池電機車的電機換向器發生故障時，可以采取以下處理方法：

1. 檢查電源和電纜連接：首先，檢查電機換向器的電源供應和電纜連接情況。確保電源供應正常且電纜連接緊固可靠。

2. 檢查控制信號：檢查控制信號線路，包括傳感器和控制器之間的連接。確保控制信號傳輸正常，并排除信號線路故障的可能性。

3. 檢查電機換向器本身：檢查電機換向器本身是否存在損壞或故障。可能出現的問題包括電路板損壞、元件燒毀等。如果發現問題，需要進行修復或更換電機換向器。

4. 故障診斷工具：使用適當的故障診斷工具，如多用途電表或故障診斷儀，來檢測電機換向器的工作狀態和故障代碼。根據診斷結果采取相應的修復措施。

需要注意的是，對于蓄電池電機車電機換向器的故障處理，建議由經驗豐富的技術人員或專業維修人員進行操作。他們具備相關的知識和技能，能夠準確診斷故障并采取適當的修復措施。